Vu sur la toile #182

« Le séquençage du génome de Ceratopteris richardii, petite fougère aquatique, est une prouesse, car son génome est gigantesque. On commence à comprendre pourquoi et l’on découvre au passage que la plante a « volé » à des bactéries des gènes de défense contre les herbivores !

Il aura fallu huit ans à une cinquantaine de chercheurs de 28 institutions pour venir à bout du séquençage du génome de Ceratopteris richardii (fougère de Richard) et de son assemblage, c’est-à-dire l’ordonnancement des données brutes de séquençage. Originaire des milieux aquatiques dans les régions tropicales et subtropicales, cette plante est également une espèce modèle en génétique végétale, facile à cultiver en laboratoire avec un cycle de vie court d’environ six semaines. C’est même une des rares plantes à avoir poussé dans l’espace, lors d’une mission de la navette spatiale américaine Columbia en 1999. Sur le plan génétique, les fougères sont connues pour contenir de grandes quantités d’ADN et un nombre élevé de chromosomes (Ophioglossum reticulatum détient le record connu avec 1 440 chromosomes). Résultat : le séquençage, l’assemblage et l’interprétation de leur génome sont particulièrement complexes. D’où l’importance du travail réalisé par Blaine Marchant, à l’université Stanford, aux États-Unis, et ses nombreux collègues. En venant à bout de l’assemblage du génome de cette fougère, ils ont en partie levé le voile sur l’histoire de son évolution – pourquoi elle compte tant de gènes et comment elle a intégré des gènes de défense issus de bactéries – et commencé à identifier des composés d’intérêt comme des flavonoïdes, essentiels pour l’alimentation, la médecine ou encore les biopesticides. »

Introduction de l’article

Tour d’horizon des articles, podcasts et vidéos glanés sur la toile par Tela Botanica autour des thématiques botanique et biodiversité :

• L’Ibéris intermédiaire, une plante endémique de la vallée de la Seine normande, par Le CBN de Bailleul
• Secrets d’arbres 4: le noyer, par La Salamandre
• Donner un nom aux plantes peut être un casse-tête…, par France Inter
• « Amazonie, les civilisations oubliées de la forêt », sur Arte : sous les arbres, les hommes…, par Le Monde
• L’Inde veut raser la forêt tropicale de l’île du Grand Nicobar pour y installer une base militaire, par RFI
• Comment les atomes furent-ils découverts ?, par France Culture
• Le basilic, par le blog Herbier de Gallica – BNF
• Des chercheurs pensent avoir résolu le mystère de la propagation des plantes sur la terre ferme, par GEO