Sous le Botascope : Back to the Trees

L’action exploratoire Back to the Trees a vu le jour au Centre INRIA de l’Université de Rennes. Cette action transdisciplinaire est portée par Simon Castellan avec le concours du bio-informaticien Éric Tannier de l’INRIA Lyon et du botaniste Jos Käfer, de l’ISEM de Montpellier. Une action exploratoire Inria est un dispositif interne pour faciliter l’émergence de nouvelles thématiques de recherche en donnant aux scientifiques les moyens de tester des idées originales.

L’ambition ?  Forger un outil capable de modéliser les connaissances en morphologie botanique pour ensuite identifier une plante. Pour cela deux axes de recherche sont développés.

Le premier part d’un constat, il n’existe pas de système formel consensuel pour la description d’une espèce végétale. Et pour compliquer encore un peu les choses, au sein d’une même espèce, les plantes ne se ressemblent pas toutes. L’enjeu est de réussir à proposer un modèle de formalisation des descriptions botaniques.

Le deuxième axe vise à générer des clés de détermination en s’appuyant sur cette formalisation. Un problème en réalité très complexe. Car pour aider l’observateur d’une plante à avancer dans sa description, il faut produire un système de questionnaire où s’enchevêtrent énormément de critères selon de multiples déroulés.

Pour que ces clés de détermination soient pleinement efficaces, elles doivent posséder une qualité supplémentaire : “La tolérance aux erreurs.” Avec une clé classique, si le botaniste part dans la mauvaise direction du livre, il s’enferme dans une impasse et c’est ce que ce nouvel outil permet d’éviter.

L’application pourra servir aux botanistes durant leurs observations, mais aussi au grand public à des fins pédagogiques. Tout un chacun pourra apprendre la botanique par une observation fine de la plante et comprendre le principe d’une clé de détermination.

L’idée est de générer de petites clés plutôt que d’en avoir une seule grande. Cette malléabilité de l’outil permet de créer des supports en fonction d’un territoire, d’un public, d’un objectif naturaliste ou pédagogique. Les clefs obtenues sont soit sous forme numérique, utilisables avec un smartphone ou un ordinateur, soit sous format papier, avec un livret personnalisé constitué de fiches pour chaque espèce étudiée. Ces fiches comprendront des informations sur la morphologie de l’espèce, son écologie, sa reproduction et toutes caractéristiques utiles pour des botanistes amateurs ou chevronnés.

Pour faire progresser l’outil, les chercheurs travaillent en co-construction avec des associations locales. Nous vous en reparlerons prochainement.

Source de cet article pour aller plus loin : Un outil innovant pour caractériser les plantes | Inria