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Lien vers documentation du site.
Les filtres : "annee", "auteur", "departement", "commune", "precisiongeo", "nomsci", "fournier", "floeur", "algues", "characees", "bryo", "lichen", "syntri", "bdnff", "ciff", "codefr"
à lier avec les opérateurs
"inf" => inférieur, "sup" => supérieur, "eg" => égal, "neg" => non égal, "infeg" => inférieur ou égal, "supeg" => supérieur ou égal, "in" => liste de choix, "like" => comme ou commençant par ou comprenant
ex: annee:sup:1990/annee:inf:2000/auteur:like:ma%/departement:in:14,50,61,76,27/nomsci:like:trifolium%/fournier:neg:
c'est-à -dire les observations dont l'année de publication est compriseentre 1990 et 2000, le nom d'auteur commence par ma, présent dans les départements 14,50,61,76,27, du genre trifolium et qui posséde un numéro de fournier
Entre ces deux marques de début et de fin, se situent les données proprement dites. Les tableaux d’une même référence sont disposés les uns à la suite des autres. Les références sont regroupées par dix dans un même fichier.
Nb. lorsque le nombre de tableaux dépasse 100 dans une publication, un second numéro de référence est attribué à cette seconde partie des tableaux dont la numérotation repart à 1.
Format des fichiers Stations
SOPHY
Site
Le site SOPHY est hébergé sur le serveur de Tela Botanica : http://sophy.tela-botanica.orgLien vers documentation du site.
Export
Les champs possibles à exporter sont :- "code_identifiant" => code regroupant les numéros de publibation,tableau, relevé, ligne, taxon et strate
- "code_identifiant_relevé" => même code pour le même relevé.
- "numero_publication" => numéro donné à une publication dans SOPHY
- "publication" => auteur, revue, volume, tome, fascicule, date, titre de l'article, numéro page début, numéro page fin
- "auteur"
- "annee"
- "numero_tableau" => numéro du tableau dans la publication
- "numero_releve" => numéro du relevé dans le tableau
- "nom_station" => très variable mais contenant principalement soit unlieu-dit soit une description du milieu
- "code_insee"
- "code_insee_calcule" => calculer grâce aux coordonnées
- "altitude"
- "coordonnees_wgs"
- "coordonnees_utm"
- "precision_geographique" => 1 (pointé sur une carte), 2 (dans un lieu-dit), 3 (centre de la commune)
- "nom_scientifique_retenu" => nom retenu BDNFF
- "nom_scientifique_initial" => nom donné dans SOPHY
- "flore" => une colonne pour chaque flore utilisé pour SOPHY contenant le numéro du nom
- "strate" => 1 (semis ou jeunes plantes (ligneuses)), 2 (intermédiaire semis/broussailles), 3 (taille broussailles jusqu'à 2m env.), 4 (intermédiaire broussailles/grands arbres), 5 (grands arbres), 7-8-9 (TIS),0 (pas de strate)
- "code_abondance" => + (individus rares (ou très rares) et recouvrement très faible), 1 (individus assez abondants, mais recouvrement faible), 2 (individus assez abondants, mais recouvrement faible), 3 (individus assez abondants, mais recouvrement faible), 4 (nombre d'individus quelconque, recouvrement 1/2 à 3/4), 5 (nombre d'individus quelconque, recouvrement plus de 3/4), ? (aucune abondance pour le taxon)
Les filtres : "annee", "auteur", "departement", "commune", "precisiongeo", "nomsci", "fournier", "floeur", "algues", "characees", "bryo", "lichen", "syntri", "bdnff", "ciff", "codefr"
à lier avec les opérateurs
"inf" => inférieur, "sup" => supérieur, "eg" => égal, "neg" => non égal, "infeg" => inférieur ou égal, "supeg" => supérieur ou égal, "in" => liste de choix, "like" => comme ou commençant par ou comprenant
ex: annee:sup:1990/annee:inf:2000/auteur:like:ma%/departement:in:14,50,61,76,27/nomsci:like:trifolium%/fournier:neg:
c'est-à -dire les observations dont l'année de publication est compriseentre 1990 et 2000, le nom d'auteur commence par ma, présent dans les départements 14,50,61,76,27, du genre trifolium et qui posséde un numéro de fournier
Documentation sur les formats des fichiers de SOPHY
- Lien vers questions Ă poser
Sources d'informations
Fichiers complémentaires
- Correspondance code CIFF-BDNFF de Benoit Bock
- Télécharger le fichier 2010-10-28_importation donnĂ©es brutes SOPHY.pdf
Fichier des références bibliographiques
Les références sont présentées sous deux formes, l’une découlant de l’autre :- un fichier texte (IMPALPHA)
- un fichier dbf (BIBLIO.DBF)
Structure des données phytosociologiques et de leurs localisations (Données brutes)
Les données phytosociologiques et leurs localisations sont rassemblées sous forme de tableaux et agrégés en fichiers distincts. Un tableau débute par une ligne comportant le numéro de la référence bibliographique, celui du tableau dans la référence, le nombre de relevés, ainsi que le titre donné par le phytosociologue. Cette ligne est identique pour les tableaux comme pour les stations. Les tableaux se terminent par une ligne de 9.Entre ces deux marques de début et de fin, se situent les données proprement dites. Les tableaux d’une même référence sont disposés les uns à la suite des autres. Les références sont regroupées par dix dans un même fichier.
Nb. lorsque le nombre de tableaux dépasse 100 dans une publication, un second numéro de référence est attribué à cette seconde partie des tableaux dont la numérotation repart à 1.
Fichiers des tableaux floristiques (Données brutes)
Les fichiers floristiques permettent de dénommer les plantes des fichiers « tableaux phytosociologiques ».Fichiers des tableaux phytosociologiques (Données brutes, dossiers tableaux, rlv et T)
Fichiers des stations (Données brutes, dossier ST)
Les stations correspondent au lieu où l’on travaille. Les relevés sont constitués par la liste des plantes observées dans la station.Format des fichiers Stations
Base de données
