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Questions sur les formats des fichiers de SOPHY


Dans le cadre du transfert des relevés de Sophy vers Eflore, nous travaillons sur les données brutes. Nous avons réalisé une analyse de ces fichiers et avons quelques questions (ci-joint l'analyse effectuée).

Référence
- Dans le fichier BIBLIO.DBF, Ă  quoi correspondent les champs nusivim, them1, them2 et biblio?
- Conseillez-vous d'utiliser BIBLIO.DBF ou IMPALPHA ?

Flore
- dans le dossier FLORE, quels sont les fichiers à utiliser pour "transformer" les données brutes en nomenclature BDNFF ?
  • SOPHYCPL pour la transformation codage de Fournier (numĂ©ro de page, numĂ©ro de colonne, numĂ©ro de perforation)/numĂ©ro de Fournier
  • LISTEPLA pour la correspondance BDNFF/Fournier
  • SYNTRI pour le code Ă  6 chiffres prĂ©sent en bout de ligne (voir description du format des fichiers Tableau) / numĂ©ro de Fournier
  • SYDONI pour la correspondance codage de Fournier/code CIFF
- dans le fichier SOPHYCPL, à quoi correspond le dernier code (6ème colonne, avant le nom d'espèce) ?

Tableau
- pourquoi y a-t-il 3 dossiers (tableaux, T, rlv) ?
- quelques fichiers sont en double : sans extension et avec extension .PRC. Faut-il bien utiliser celui sans extension ?
- il semble que les plantes soient toujours désignées par leur "code Fournier" (5 caractères) sauf vos données (publication 3) désignées par leur N° de Fournier à 4 caractères... est-ce vrai? Si oui, cela concerne-t-il d'autres publications que la 3 ?
- toujours dans cette publication 3, à quoi correspond le 836 en début de la deuxième ligne:
3 1 30 RELEVES PHYTOCLIMATIQUES EFFECTUES PAR H. BRISSE ET G. GRANDJOUAN. 6
405836 1 437-+ 937-+ 1002-1 1114-+ 1628-+ 1785-+ 1669-+ 1914-+ 1962-+ 1981-2
  • et plus gĂ©nĂ©ralement quand les donnĂ©es sont disposĂ©es avec les stations en lignes, Ă  quoi correspondent les caractères en dĂ©but de ligne (numĂ©ro de station et ?) ?
- quelle valeur peut prendre la strate (dans les fichiers, présence des valeurs : 1, 2, 3, 4, 5 et 7) ?
- à quoi correspond le dernier caractère avant les abondances : F, B ou *
- à quoi correspond le dernier code en bout de ligne après la liste des abondances (6 chiffres présents dans le fichier flore syntri) ?
- Ă  quoi correspondent les codes que l'on peut trouver entre * : CI pour CIFF mais N et S ?
- certaines espèces sont sans code, peut-on les supprimer ?


Station
- Les fichiers sont en double ou triple exemplaire. Quel dossier faut-il donc plutĂ´t utiliser ?
  • ceux du sous-rĂ©pertoire TOUST (semble complet)
  • les fichiers Ă  la racine
  • les sous-rĂ©pertoires rĂ©pertoire ST
- Pourquoi les fichiers sont-ils nommés S jusqu'à la publication 500 puis ST à partir de la publication 501?
- Certaines stations sont saisies dans deux fichiers différents (exemple: S312318 et S311320), et ne présentent pas le même contenu.
  • Par exemple, le relevĂ© 2 du tableau 2 de la publication 312 [BOIS DE FAU-TIMON, BOVES (80)] n'a pas de coordonnĂ©es gĂ©ographiques dans le fichier S312318, alors qu'il en a dans le fichier S311320
  • Y a-t-il une règle Ă  connaĂ®tre?
- à quoi correspond le code à 4 chiffre en début de ligne ?
  • Est-ce le numĂ©ro des relevĂ©s au sein de chaque tableau ? Si oui, pourquoi cette numĂ©rotation n'est-elle pas toujours continue au sein d'un tableau ?
  • Voire parfois "anarchique" (exemple Publi 3248 / tableau 1), ou contenant des lettres (exemple publi 3031 / tableau 3)?
  • Cela ne correspond donc pas au N° de relevĂ©s (2 chiffres) des fichiers ADSTA ?
- Comment savoir quel est le relevé 1, 2, 3, ... d'un tableau ? Est-ce seulement par son ordre d'apparition dans la liste?
- La codification des pays suit-elle un standard ?

Questions en vrac
- pouvez-vous nous envoyer les codes sources non compilés en fortran des programmes d'analyse des tableaux?