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Description des champs de la BDNFF


Champs contenu dans le fichier tabulé :


Nom fichier tabulé : num_nomenclatural
Nom File Maker : "D:n° nomenclatural"
Type : int (entier)
Taille indicative : 6
Aide : ce champ contient le numéro nomenclatural. Chaque nom possède un numéro nomenclatural distinct.

Nom fichier tabulé : num_taxonomique
Nom File Maker : "D:n° taxonomique"
Type : int (entier)
Taille indicative : 6
Aide : ce champ contient le numéro taxonomique. Tous les noms (quelque soit leur statuts) d'un taxon possède le même numéro taxonomique.

Nom fichier tabulé : num_nom_valide
Nom File Maker : "D:Num nom valide" ou "D:Num NomRetenu"
Type : int (entier)
Taille indicative : 6
Aide : ce champ contient le numéro nomenclatural

Nom fichier tabulé : rang_taxonomique
Nom File Maker: "I:Rang taxonomique"
Type : int (entier)
Taille indicative : 4
Aide : ce champ contient un code correspondant au rang taxonomique du nom.
Code : 0=inconnu
  • 1=espèce
  • de 10 Ă  99=sous-espèce
  • de 100 Ă  999=rang infraspècifique de niveau 2
  • > 1000=rang infraspècifique de niveau 3

Plus précisément, le rang taxonomique est codé sous forme binaire:
1 = espèce
10 = sous-espèce dont l'épithète est le même que l'espèce = sous-espèce type
11 = sous-espèce dont l'épithète est différent de celui de l'espèce = sous-espèce non type
1 (1 ou 0) 0= 110 ou 100 = variété type (épithète est le même que celui du rang supérieur)
1 (1 ou 0) 1 = 101 ou 111 = variété dont l'épithète est différent de celui du rang supérieur
1 ( 1 ou 0 & 1ou 0) 0 = 1000 ou 1100 ou 1010 ou 1110 = forme type
1 ( 1 ou 0 & 1ou 0) 1 = 1001 ou 1101 ou 1011 ou 1111 = forme non type

Nom fichier tabulé : nom_famille
Nom File Maker : "D:Famille Cronquist"
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 20
Aide : ce champ contient le nom de la famille.

Nom fichier tabulé : nom_genre
Nom File Maker : "D:Genre"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient le nom de genre.

Nom fichier tabulé : nom_sp
Nom File Maker : "D:Espèce"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'épthète d'espèce.

Nom fichier tabulé : auteur_sp
Nom File Maker: "D:AuteurEspèce" ou "D:Auteur"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'espèce.

Nom fichier tabulé : type_subsp
Nom File Maker : "D:Type de subsp." ou "D: TypeSousEspèce"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé du rang de sous-espèce.

Nom fichier tabulé : nom_subsp
Nom File Maker : "D:Sous espèce"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'épithète de sous-espèce.

Nom fichier tabulé : auteur_subsp
Nom File Maker : "D:AuteurSubsp"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de la sous-espèce.

Nom fichier tabulé : type_infra2
Nom File Maker : "D:Type de l'infra2"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé du rang infraspécifique de niveau 2.

Nom fichier tabulé : nom_infra2
Nom File Maker : "D:Infra2"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'épithète infraspécifique de niveau 2.

Nom fichier tabulé : auteur_infra2
Nom File Maker : "D:AuteurInfra2"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'épithète infraspécifique de niveau 2.

Nom fichier tabulé : type_infra3
Nom File Maker : "D:Type de l'infra3"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé du rang infraspécifique de niveau 3.

Nom fichier tabulé : nom_infra3
Nom File Maker : "D:Infra3"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'épithète infraspécifique de niveau 3.

Nom fichier tabulé : auteur_infra3
Nom File Maker : "D:AuteurInfra3"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'épithète infraspécifique de niveau 3.

Nom fichier tabulé : source_biblio
Nom File Maker : "D:Source Biblio du taxon" ou "source"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient la citation bibliographique du nom.

Nom fichier tabulé : annee
Nom File Maker : "D:Année"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'année correspondant à la citation bibliographique du nom.

Nom fichier tabulé : source_biblio_exclure
Nom File Maker : "D:Source Biblio Ă  exclure"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient les citations bibliographiques du nom qui sont Ă  exclure.

Nom fichier tabulé : info_combinaison
Nom File Maker : "D:Infos sur la comb."
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 100
Aide : ce champ contient les commentaires nomenclaturaux du nom.

Nom fichier tabulé : type_synonymie
Nom File Maker : D:type de synonymie
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 2
Aide : ce champ contient un code indiquant le type de synonymie du nom.
Code :
  • n = synonyme nomenclatural (ou homotypique) (nom de mĂŞme rang basĂ© sur le mĂŞme type)
  • t = synonyme taxonomique (ou hĂ©tĂ©rotypique) (nom basĂ© sur un type diffĂ©rent)
  • o = synonyme nomenclatural ou taxonomique non diffĂ©renciĂ© (basionyme exclus)
  • i = inclus dans
  • s = au sens de
  • a = autonyme
Ajout depuis version 3 :
  • an = antonyme (synonyme exclu)
  • vo = variant orthographique (variant orthographique incorrect d'un nom) ou pseudonyme (synonyme par mĂ©susage du nom)
  • is = isonyme (synonyme de mĂŞme nom basĂ© sur le mĂŞme type)

Nom fichier tabulé : doute_nom_valide
Nom File Maker : "D:Doute nom valide"
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 2
Aide : ce champ contient des informations en cas de doute sur le nom correct.
  • 1 = ?
  • 2 = (sans correspondance)
  • 3 = subsp. ?
  • 4 = var. ?
  • 5 = p.p.
  • 6 = (nom collectif)
  • 7 = incl. in
  • 8 = (sans correspondance mais du groupe :
  • (La valeur 9 n'existe pas. Elle a Ă©tĂ© supprimĂ©e.)
  • 10 = convar. ?
  • 11 = (identitĂ© incertaine)
  • 12 = sensu lato

Nom fichier tabulé : hybride
Nom File Maker : "D:Hybride"
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 20
Aide : ce champ contient des informations sur les hybrides.
Code : x = hybride
  • x (<), x (>), x (><), x (><<), x (>><) = forme intermĂ©diaire indiquant l'influence des parents (notamment pour les Hieracium)

Nom fichier tabulé : auteur_principal
Nom File Maker : "D:Auteur principal"
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 80
Aide : ce champ contient l'intitulé de l'auteur principal du nom, c'est à dire du créateur de la combinaison.

Nom fichier tabulé : in_auteur
Nom File Maker : "D:in auteur"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé d'auteur devant figurer devant la citation bibliographique et précédé par le mot "in".

Nom fichier tabulé : statut
Nom File Maker : "D:Statut"
Type : int (entier)
Taille indicative : 1
Aide : ce champ contient un code indiquant si le nom est correct ou synonyme. Pour connaître le nom correct d'un taxon, il faut rechercher tous les noms ayant le même numéro taxonomique et regarder celui pour lequel le statut vaut "nom correct".
Code :
0 = nom sans correspondance ou collectif
1 = nom correct
2 = synonyme
3 = 0 = nom sans correspondance ou collectif
4 = ATTENTION : dans la BDNBE cela correspond Ă  "synonyme provisoire". Il me semble qui'il faudrait fusionner le champ "D:Statut" et le champ "D:type de synonymie".

Nom fichier tabulé : nom_complet
Nom File Maker : "EXP:Nom complet"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient l'intitulé formaté complet du nom.

Nom fichier tabulé : flores
Nom File Maker : "D:Flores"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient les codes des flores dans lesquelles le nom est présent.
Code : voir les codes de Kerguélen sur le site de l'INRA. Ce champ est voué à disparaître : il sera remplacé par des champs propres à chacune des flores incluants des informations plus précises (n° utilisés dans la-dite flore). Ces numéros peuvent être trouvées après le commentaire nomenclatural sensu:
  • 1 = BONNIER & LAYENS, 1894. Tables synoptiques des plantes vasculaires de la flore de France.
  • 2 = COSTE, 1899-1906. Flore illustrĂ©e France, (3 vol.).
  • 3 = FOURNIER, 1934-1940. Quatre Flores de France.
  • 3* = FOURNIER, additions dans l'Ă©dition de 1961.
  • 4 = TUTIN & al., 1964-1980. Flora Europaea, (5 vol.).
  • 4* = Flora Europaea, Ă©dition 2 (Vol. 1), voir TUTIN & al. (1993), abrĂ©gĂ©e en FE2. L'indication est surtout donnĂ©e quand la citation n'a pas Ă©tĂ© faite dans 4 (supplĂ©mentaire ou modifiĂ©e).
  • 5 = GUINOCHET & VILMORIN, 1973-1984. Flore de France, Ă©d. C.N.R.S., (5 vol.).
  • 6 = KERGUÉLEN, 1993. Liste synonymique de la flore de France.

Nom fichier tabulé : indic_geo
Nom File Maker : "D:Indic.géo"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient les codes de zones géographique provenant du document original de Kerguélen.
Code : voir les codes de Kerguélen sur le site de l'INRA rappelés ci-dessous. Le contenu de ce champ est à utiliser avec précaution et nécessite des vérifications. Il ne devrait pas être inclus dans ce fichier nomenclatural. On a voulu conserver l'information de l'ISFF de Kerguélen.
  • Co = taxon prĂ©sent en Corse (Corsica)
  • Ga = taxon prĂ©sent en France (Gallia).
  • GaA = taxons adventices
  • GaC ou C = taxons cultivĂ©s
  • GaD = taxons Ă©teints ou disparus
  • GaE = taxons Ă  exclure, absents de France
  • GaI = prĂ©sence incertaine ou douteuse
  • GaN = taxons naturalisĂ©s
  • J = taxons prĂ©sents uniquement dans les jardins
Pour information les codes utilisés dans la partie "géographie" de la base sont différents entre le document ISFF-INRA et la BDNFF, voici les correspondances :
  • "GaA" dans la BDNFF = "A Ga" dans le document ISFF-INRA = taxons Adventices
  • "GaC" ou "C" dans la BDNFF = "C" dans le document ISFF-INRA = taxons CultivĂ©s
  • "GaD" dans la BDNFF = "E Ga" dans le document ISFF-INRA = taxons Ă©teints ou Disparus
  • "GaE" dans la BDNFF : "GA" dans la version ISFF-INRA = taxons Ă  Exclure, absents de France
  • "GaI" dans la BDNFF = "D Ga" dans la version ISFF-INRA = PrĂ©sence Incertaine ou douteuse
  • "GaN" dans la BDNFF = "N Ga" dans la version ISFF-INRA = taxons NaturalisĂ©s
  • "J" dans la BDNFF = "J" dans le document ISFF-INRA = taxons prĂ©sents uniquement dans les Jardins
les définitions utilisées par Kerguélen pour ces différents éléments sont données dans l'introduction téléchargeable sur le site de l'INRA.

Nom fichier tabulé : basionyme
Nom File Maker : "D:Basionyme"
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 10
Aide : ce champ contient :
  • (b.) = le nom est un basionyme.
  • (b.s.) = le nom est un basionyme d'un synonyme taxonomique.
  • (s.r.) = le nom est synonyme remplacĂ©.
Ce champ est voué à disparaitre, car le lien vers le basionyme permettra de distinguer très facilement les basionymes sans avoir à les marquer de cette manière.

Nom fichier tabulé : num_basionyme
Nom File Maker : "D:n° basionyme"
Type : int (entier)
Taille indicative : 6
Aide : ce champ contient le numéro nomenclatural du basionyme correspondant au nom.
Attention : le remplissage de ce champ est en cours à utiliser avec précaution.

Nom fichier tabulé : maj_modif
Nom File Maker : "MAJ:Modif"
Type : date (date)
Taille indicative : 10
Aide : ce champ contient la date de la dernière mise à jour. Formaté de cette façon : "jj/mm/aaaa".

Nom fichier tabulé : maj_bb
Nom File Maker : "MAJ:BB"
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 5
Aide : ce champ contient BB si la fiche a été créée par Benoit Bock.

Nom fichier tabulé : maj_creation
Nom File Maker : "MAJ:DateCréation"
Type : varchar (chaine)
Aide : ce champ contient la date de création de la ligne.

Nom fichier tabulé : remarque
Nom File Maker : "D:Remarque"
Type : text (chaine longue)
Taille indicative : environs 65000 caractères.
Aide : ce champ contient des remarques éventuelles sur le nom. Des informations expliquant les modifications par rapport à Kerguélen. Des publications
supplémentaires d'un même auteur, etc...

Nom fichier tabulé : classification
Nom File Maker : "D:classification"
Type : int (entier)
Taille indicative : 11
Aide : ce champ contient un code indiquant la division du nom :
  • 1 = Pteridophytae
  • 2 = Gymnospermae
  • 3 = Monocotyledonae
  • 4 = Dicotyledonae

Nom fichier tabulé : 2n
Nom File Maker : "D:2n"

Nom fichier tabulé : comb_nomen
Nom File Maker : "CombNomen"

Nom fichier tabulé : corrections
Nom File Maker : "D:Corrections"

Nom fichier tabulé : groupe
Nom File Maker : "D:Groupe"

Nom fichier tabulé : hybride_parent_1_num
Nom File Maker : "D:Num parent1"

Nom fichier tabulé : hybride_parent_1_doute
Nom File Maker : "D:Doute parent1"

Nom fichier tabulé : hybride_parent_2_num
Nom File Maker : "D:Num parent2"

Nom fichier tabulé : hybride_parent_2_doute
Nom File Maker : "D:Doute parent2"

Nom fichier tabulé : flore_bonnier_num
Nom File Maker : "D:NumBonnier"

Nom fichier tabulé : flore_bonnier_rem
Nom File Maker : "D:RemBonnier"

Nom fichier tabulé : flore_cnrs_num
Nom File Maker : "D:NumCNRS"

Nom fichier tabulé : flore_cnrs_rem
Nom File Maker : "D:RemCNRS"

Nom fichier tabulé : flore_fe_num
Nom File Maker : "D:NumFE"

Nom fichier tabulé : flore_fe_rem
Nom File Maker : "D:RemFE"

Nom fichier tabulé : flore_coste_num
Nom File Maker : "D:NumCoste"

Nom fichier tabulé : flore_coste_rem
Nom File Maker : "D:RemCoste"

Nom fichier tabulé : flore_fh_num
Nom File Maker : "D:NumFloraHelvetica"

Nom fichier tabulé : flore_fh_rem
Nom File Maker : "D:RemFloraHelvetica"

Nom fichier tabulé : flore_fournier_num
Nom File Maker : "D:NumFournier"

Nom fichier tabulé : flore_fournier_rem
Nom File Maker : "D:RemFournier"

Nom fichier tabulé : typus
Nom File Maker : "D:Typus"

Nom fichier tabulé : num_meme_type
Nom File Maker : "D:n°même type"

Nom fichier tabulé : presence_france
Nom File Maker : ?
Type : int (entier)
Taille indicative : 11
Aide : ce champ contient un code indiquant la présence en France :
  • 0 = absent
  • 1 = prĂ©sence (indigène ou naturalisĂ©)
  • 2 = adventice ou probable
  • 3 = taxon (seulement) cultivĂ© en France (ex. : MaĂŻs)
  • 4 = Manque d'information

Nom fichier tabulé : taxon_reel
Nom File Maker : ?
Type : int (entier)
Taille indicative : 11
Aide : ce champ contient un code fournissant des informations sur le type de taxon :
  • 0 = genre (exemple : Carex sp.)
  • 1 = taxon retenu sans rang infĂ©rieur
  • 2= taxon retenus dont il existe plusieurs rangs infĂ©rieurs existants
  • 3 = taxon dont il existe un seul taxon de rang infĂ©rieur (exemple: Agrostemma githago vaut 3, Agrostemma githago subsp. githago vaut 1)

Nom fichier tabulé : flore_belge_ed5_page
Nom File Maker : "D:PageFloreBelgeEd5"

Nom fichier tabulé : supra_genre
Nom File Maker : "D:SupraGenre"

Nom fichier tabulé : num_tax_sup
Nom File Maker : "D:NumTaxSup"


Les champs calculé à partir du fichier tabulé de la BDNFF


Nom fichier tabulé : nom_complet
Nom File Maker : aucun.
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 180
Aide : ce champ contient le nom de genre, l'épithète d'espèce, l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'espèce, l'intitulé du rang de sous-espèce, l'épithète de sous-espèce, l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de la sous-espèce, l'intitulé du rang infraspécifique de niveau 2, l'épithète infraspécifique de niveau 2, l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'épithète infraspécifique de niveau 2, l'intitulé du rang infraspécifique de niveau 3, l'épithète infraspécifique de niveau 3 et l’intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'épithète infraspécifique de niveau 3.

Nom fichier tabulé : ref_biblio_complete
Nom File Maker : aucun.
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 200
Aide : ce champ contient l'intitulé d'auteur devant figurer devant la citation bibliographique et précédé par le mot "in", l’année, la citation bibliographique du nom et les citations bibliographiques du nom qui sont à exclure.

Nom fichier tabulé : nom_valide_complet
Nom File Maker : aucun.
Type : varchar (chaine)
Taille indicative : 180
Aide : ce champ contient le nom de genre, l'épithète d'espèce, l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'espèce, l'intitulé du rang de sous-espèce, l'épithète de sous-espèce, l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de la sous-espèce, l'intitulé du rang infraspécifique de niveau 2, l'épithète infraspécifique de niveau 2, l'intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'épithète infraspécifique de niveau 2, l'intitulé du rang infraspécifique de niveau 3, l'épithète infraspécifique de niveau 3 et l’intitulé de(s) nom(s) d'auteurs de l'épithète infraspécifique de niveau 3 correspondant au nom valide.