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Qu'est-ce qu'un taxon? - Taxon concepts

Biological names can be thought of as text labels, or words, that represent some definition or concept. A taxon concept defines what the name actually means. It might be used in reference to a set of living organisms ("All the fish I examined are Pomatomus saltatrix") or it might refer to a set of shared characteristics ("Sharks have skeletons of cartilage"). The problem is that the same name may represent different concepts and it may be difficult or impossible to differentiate one from the other.

On peut considérer les noms biologiques comme des étiquettes, ou des mots qui représentent une sorte de définition ou de concept. Le concept de taxon définit ce que le nom veut réellement dire. Il pourrait être utilisé comme référence à un ensemble d'organismes vivants ("Tous les poissons que j'ai examinés sont des Pomatomus saltatrix") ou bien se référer à un ensemble des caractéristiques partagées ("Les squelettes des requins sont en cartilage"). Le problème est que le même nom peut représenter différents concepts et qu'il peut être difficile ou impossible de les différentier les uns des autres.

Two different people may use the same name to refer to different sets of organisms. In fact, the same person, over time, may change their opinion as to what a name defines. This problem is exacerbated by the fact that most of the time the only information that is actually recorded with a data object is the name itself with no way of determining what the person who used the name was thinking at the time it was written down.

Deux personnes différentes peuvent utiliser le même nom pour se référer à différents ensembles d'organismes. Cependant une même personne peut avec le temps changer d'avis sur ce que finalement ce nom définit. Ce problème est exacerbé du fait que la plupart du temps la seule information qui est enregistrée comme objet donnée est le nom lui même sans qu'il soit possible de savoir ce à quoi la personne pensait lorsqu'elle a utilisé le nom au moment où il a été enregistré.

uBio draws upon taxon concepts to represent different taxonomic viewpoints and serves these viewpoints via data structures that can be used for indexing, retrieval, and organization. The ClassificationBank? taxonomic model is only one of many taxonomic data models. The separation of ClassificationBank? from NameBank? is, in fact, to enable different taxonomic models to disagree on taxonomic concept definition while still sharing basic nomenclatural facts.

uBio s'inspire des concepts de taxon pour représenter différents points de vue taxonomiques, et accompagner ces points de vue dans la structuration des données qui peuvent être utilisées pour l'indexation, l'extraction et l'organisation. Le modèle taxonomique ClassificationBank? n'est qu'un des nombreux modèles de données taxonomiques. La séparation entre ClassificationBank? et NameBank? n'a d'autre objet que de permettre de confronter différentes définitions de modèles taxonomiques tout en partageant une nomenclature factuelle de base.

Taxon concepts represent an opinion. The recorded expression of that opinion falls within a continuum of precision. A minimal expression of a taxon concept within uBio combines a NameBank? record with a reference to an author or agency asserting an opinion. A minimal assertion regarding a NameBank? record might be that the name is considered valid or invalid.

Les concepts de taxons représentent une opinion. L'expression retenue de cette opinion s'inscrit dans un continuum précis. L'expression minimale du concept de taxon par uBio assure la combinaison d'un enregistrement NameBank? avec un auteur ou une organisation affirmant un point de vue. L'affirmation minimale concernant un enregistrement dans NameBank? peut être que le nom est considéré comme valide ou non-valide.

A more defined opinion places a valid taxon with a hierarchy to create a classification of valid taxon names. The Howard and Moore 3rd edition Birds of the World represents a contemporary viewpoint on bird taxa. [See Anser fabalis fabalis]



Synonymies provide additional information regarding what is actually circumscribed by the taxon concept. We define two distinct types of synonymies: implicit and explicit.

Implicit synonymies are lists of names that are asserted to be synonymous with a taxon but provide no additional information regarding how this synonymy is derived. The implication is (perhaps) that the types were examined but there is no direct relationship between any name-bearing data object (vouchered specimen or other) and the synonymy itself. The USDA ITIS database serves an implicit taxon concept. [See Globicephala melas, ITIS]

Implicit taxon concepts can provide additional synonyms that may be used as query terms. This can include heterotypic synonyms that would not be part of a NameBank? name concept. One criticism of the use of implicit synonyms is that while it may have value as an index, there is no relationship between the concept itself and any data object that may bear a synonymous name.

Explicit taxon concepts are circumscribed by references to specimens or taxa that themselves are circumscribed by specimens. Specimens may be indirectly referenced (represented by bibliographic citation) or directly referenced (represented by specific vouchered specimen references). The nomenclature circumscribed by the specimens and reconciled against the relevant nomenclatural codes determines the valid name and synonymy of the concept. Extension of the synonymy to data objects outside of the explicit circumscription can only be inferential.

The uBio ClassificationBank? can represent and serve both implicit and explicit taxon concepts. The current ClassificationBank?, with it's publication orientation, serves only indirectly-referenced explicit taxon concepts. The bibliographic circumscription is derived from NameBank? chresonyms. The factual basis of the chresonym defintion enables a single specimen reference to be re-interpreted within different taxon concepts. [See Globicephala melaena melaena, Hershkovitz]